Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms