Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms