Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms