Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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LINC00597Q9H2U6 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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LINC00597Q9H2U6 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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LINC00597Q9H2U6 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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LINC00597Q9H2U6 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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LINC00597Q9H2U6 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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LINC00597Q9H2U6 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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LINC00597Q9H2U6 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00597Q9H2U6 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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LINC00597Q9H2U6 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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LINC00597Q9H2U6 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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