Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN8

C20orf27, UPF0687 protein C20orf27, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf27Q9GZN8 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms