Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZL8

BPESC1, Putative BPES syndrome breakpoint region protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPESC1Q9GZL8 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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