Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms