Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B6

BRINP2, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP2Q9C0B6 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRINP2Q9C0B6 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms