Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ76

CNTNAP3, Contactin-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP3Q9BZ76 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNTNAP3Q9BZ76 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNTNAP3Q9BZ76 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNTNAP3Q9BZ76 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNTNAP3Q9BZ76 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNTNAP3Q9BZ76 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNTNAP3Q9BZ76 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNTNAP3Q9BZ76 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNTNAP3Q9BZ76 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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CNTNAP3Q9BZ76 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNTNAP3Q9BZ76 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CNTNAP3Q9BZ76 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CNTNAP3Q9BZ76 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CNTNAP3Q9BZ76 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNTNAP3Q9BZ76 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNTNAP3Q9BZ76 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CNTNAP3Q9BZ76 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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CNTNAP3Q9BZ76 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNTNAP3Q9BZ76 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNTNAP3Q9BZ76 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNTNAP3Q9BZ76 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNTNAP3Q9BZ76 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CNTNAP3Q9BZ76 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNTNAP3Q9BZ76 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNTNAP3Q9BZ76 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNTNAP3Q9BZ76 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNTNAP3Q9BZ76 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNTNAP3Q9BZ76 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNTNAP3Q9BZ76 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CNTNAP3Q9BZ76 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CNTNAP3Q9BZ76 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTNAP3Q9BZ76 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTNAP3Q9BZ76 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTNAP3Q9BZ76 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTNAP3Q9BZ76 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTNAP3Q9BZ76 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTNAP3Q9BZ76 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CNTNAP3Q9BZ76 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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