Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms