Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms