Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms