Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms