Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms