Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CAPZA3Q96KX2 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CAPZA3Q96KX2 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CAPZA3Q96KX2 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CAPZA3Q96KX2 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPZA3Q96KX2 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPZA3Q96KX2 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPZA3Q96KX2 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPZA3Q96KX2 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPZA3Q96KX2 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPZA3Q96KX2 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPZA3Q96KX2 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPZA3Q96KX2 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPZA3Q96KX2 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPZA3Q96KX2 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPZA3Q96KX2 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPZA3Q96KX2 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPZA3Q96KX2 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPZA3Q96KX2 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPZA3Q96KX2 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPZA3Q96KX2 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPZA3Q96KX2 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPZA3Q96KX2 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPZA3Q96KX2 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPZA3Q96KX2 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPZA3Q96KX2 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPZA3Q96KX2 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPZA3Q96KX2 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPZA3Q96KX2 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPZA3Q96KX2 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPZA3Q96KX2 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPZA3Q96KX2 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPZA3Q96KX2 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPZA3Q96KX2 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPZA3Q96KX2 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPZA3Q96KX2 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms