Protein–RNA interactions for Protein: Q96JT2

SLC45A3, Solute carrier family 45 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC45A3Q96JT2 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC45A3Q96JT2 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms