Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ2

CLMN, Calmin, humanhuman

Predictions only

Length 1,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMNQ96JQ2 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLMNQ96JQ2 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms