Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms