Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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RTP4Q96DX8 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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RTP4Q96DX8 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTP4Q96DX8 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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