Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVB6

CHTF18, Chromosome transmission fidelity protein 18 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18Q8WVB6 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHTF18Q8WVB6 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms