Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDU6

GPBAR1, G-protein coupled bile acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBAR1Q8TDU6 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.08■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPBAR1Q8TDU6 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms