Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHG7

SVIP, Small VCP/p97-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVIPQ8NHG7 SPATA33-201ENST00000301031 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 TKTL1-202ENST00000369915 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 ZNF879-201ENST00000444149 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 ZNF621-201ENST00000310898 2404 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 APC2-203ENST00000535453 11656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 EHD1-201ENST00000320631 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 MAGEL2-201ENST00000532292 4298 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 RAP1GAP-206ENST00000374765 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 CALD1-201ENST00000361675 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 FANCA-202ENST00000389301 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 TMC2-201ENST00000358864 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 LRTM2-201ENST00000299194 3688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 AL021155.1-201ENST00000438808 2637 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 GOLGA2-201ENST00000421699 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 SP140-204ENST00000417495 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 ERCC2-204ENST00000391945 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 SORBS3-201ENST00000240123 3459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 RGS12-201ENST00000336727 4674 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 AC068299.1-201ENST00000624716 1749 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 DOCK6-201ENST00000294618 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 CREB5-204ENST00000396300 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 FBXO44-202ENST00000251547 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 TNFSF13B-201ENST00000375887 2582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 FRMD7-201ENST00000298542 3198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 PARP8-219ENST00000514067 2829 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 AP002847.1-201ENST00000625136 2245 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 AC023509.3-202ENST00000591834 1609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 ZNF140-202ENST00000355557 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 LINC00434-201ENST00000423739 419 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 VPS8-204ENST00000424463 2359 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 EXT2-203ENST00000395673 3454 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 MUC13-205ENST00000616727 2879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 IFNG-AS1-202ENST00000538665 1791 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 UTY-203ENST00000362096 4990 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 AL807761.4-201ENST00000439901 2277 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 MMS19-209ENST00000438925 3797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 HEXA-201ENST00000268097 5252 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 LUCAT1-203ENST00000513626 2672 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 RP1-207ENST00000637698 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 NFATC1-202ENST00000318065 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 UTP3-201ENST00000254803 2073 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 AC023355.1-202ENST00000612262 4242 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 MYH3-205ENST00000583535 6037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 MAGEE2-201ENST00000373359 2249 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 AC183088.1-201ENST00000626622 3398 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 PNPLA6-204ENST00000545201 4502 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 DPP9-201ENST00000262960 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 AMIGO2-203ENST00000550413 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 LINC01234-201ENST00000510694 1467 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 ASIC2-202ENST00000359872 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 BCAS3-217ENST00000588462 3559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 KIF13A-201ENST00000259711 5941 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 SEMA4D-212ENST00000450295 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 PPP1R12A-201ENST00000261207 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 NAPB-207ENST00000617876 3883 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 PITRM1-203ENST00000380994 2579 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms