Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms