Protein–RNA interactions for Protein: Q8N283

ANKRD35, Ankyrin repeat domain-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD35Q8N283 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms