Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALYREFQ86V81 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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