Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
WDR53Q7Z5U6 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms