Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 AC053503.3-201ENST00000448375 114 ntBASIC21.33■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC21.33■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC21.32■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC21.32■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC21.31■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC21.31■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 CTBP2P6-201ENST00000526402 1229 ntBASIC21.31■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC21.31■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 AC142086.5-202ENST00000562500 217 ntBASIC21.31■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC21.31■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC21.31■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 TNFRSF12A-204ENST00000573001 648 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC21.3■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 DYNLT1-201ENST00000367085 774 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC21.29■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms