Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms