Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC18■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC18■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC18■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms