Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms