Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms