Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms