Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF123Q5XPI4 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF123Q5XPI4 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF123Q5XPI4 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF123Q5XPI4 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF123Q5XPI4 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF123Q5XPI4 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF123Q5XPI4 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF123Q5XPI4 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF123Q5XPI4 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF123Q5XPI4 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF123Q5XPI4 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF123Q5XPI4 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF123Q5XPI4 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF123Q5XPI4 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF123Q5XPI4 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF123Q5XPI4 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF123Q5XPI4 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF123Q5XPI4 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF123Q5XPI4 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF123Q5XPI4 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF123Q5XPI4 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF123Q5XPI4 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF123Q5XPI4 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF123Q5XPI4 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF123Q5XPI4 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF123Q5XPI4 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF123Q5XPI4 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF123Q5XPI4 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF123Q5XPI4 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF123Q5XPI4 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF123Q5XPI4 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF123Q5XPI4 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF123Q5XPI4 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF123Q5XPI4 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF123Q5XPI4 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF123Q5XPI4 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF123Q5XPI4 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF123Q5XPI4 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF123Q5XPI4 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF123Q5XPI4 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF123Q5XPI4 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF123Q5XPI4 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF123Q5XPI4 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF123Q5XPI4 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF123Q5XPI4 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF123Q5XPI4 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF123Q5XPI4 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF123Q5XPI4 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF123Q5XPI4 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF123Q5XPI4 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF123Q5XPI4 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF123Q5XPI4 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF123Q5XPI4 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF123Q5XPI4 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF123Q5XPI4 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF123Q5XPI4 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF123Q5XPI4 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF123Q5XPI4 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF123Q5XPI4 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF123Q5XPI4 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF123Q5XPI4 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF123Q5XPI4 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF123Q5XPI4 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF123Q5XPI4 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF123Q5XPI4 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF123Q5XPI4 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF123Q5XPI4 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF123Q5XPI4 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF123Q5XPI4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF123Q5XPI4 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF123Q5XPI4 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF123Q5XPI4 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF123Q5XPI4 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF123Q5XPI4 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF123Q5XPI4 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF123Q5XPI4 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF123Q5XPI4 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF123Q5XPI4 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF123Q5XPI4 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF123Q5XPI4 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF123Q5XPI4 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF123Q5XPI4 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF123Q5XPI4 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF123Q5XPI4 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF123Q5XPI4 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF123Q5XPI4 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF123Q5XPI4 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF123Q5XPI4 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF123Q5XPI4 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF123Q5XPI4 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF123Q5XPI4 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF123Q5XPI4 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF123Q5XPI4 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF123Q5XPI4 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF123Q5XPI4 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF123Q5XPI4 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF123Q5XPI4 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF123Q5XPI4 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF123Q5XPI4 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms