Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 URB1-AS1-201ENST00000534991 831 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 MIR4640-201ENST00000581824 90 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 HLF-202ENST00000430986 1385 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 SPATS1-202ENST00000323108 1107 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 Metazoa_SRP.210-201ENST00000637921 244 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 RN7SL173P-201ENST00000461853 292 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 FXYD6-208ENST00000529335 708 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms