Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms