Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms