Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms