Protein–RNA interactions for Protein: Q3B8N5

PROX2, Prospero homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX2Q3B8N5 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 AC022087.1-201ENST00000558372 612 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 AC008750.5-201ENST00000595500 473 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 AC005529.1-201ENST00000411969 289 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms