Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms