Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HADHQ16836 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HADHQ16836 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HADHQ16836 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HADHQ16836 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HADHQ16836 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HADHQ16836 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HADHQ16836 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HADHQ16836 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HADHQ16836 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HADHQ16836 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HADHQ16836 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HADHQ16836 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HADHQ16836 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HADHQ16836 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HADHQ16836 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HADHQ16836 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HADHQ16836 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HADHQ16836 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HADHQ16836 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HADHQ16836 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HADHQ16836 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HADHQ16836 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HADHQ16836 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HADHQ16836 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HADHQ16836 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HADHQ16836 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HADHQ16836 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HADHQ16836 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HADHQ16836 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HADHQ16836 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HADHQ16836 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HADHQ16836 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HADHQ16836 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HADHQ16836 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HADHQ16836 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HADHQ16836 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HADHQ16836 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HADHQ16836 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HADHQ16836 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HADHQ16836 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HADHQ16836 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HADHQ16836 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HADHQ16836 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HADHQ16836 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HADHQ16836 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HADHQ16836 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HADHQ16836 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HADHQ16836 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HADHQ16836 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HADHQ16836 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HADHQ16836 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HADHQ16836 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HADHQ16836 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HADHQ16836 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HADHQ16836 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HADHQ16836 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HADHQ16836 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HADHQ16836 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HADHQ16836 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HADHQ16836 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HADHQ16836 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HADHQ16836 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HADHQ16836 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HADHQ16836 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HADHQ16836 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HADHQ16836 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HADHQ16836 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HADHQ16836 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HADHQ16836 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HADHQ16836 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HADHQ16836 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HADHQ16836 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HADHQ16836 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HADHQ16836 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HADHQ16836 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HADHQ16836 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HADHQ16836 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HADHQ16836 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HADHQ16836 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HADHQ16836 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HADHQ16836 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HADHQ16836 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HADHQ16836 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HADHQ16836 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HADHQ16836 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HADHQ16836 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HADHQ16836 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HADHQ16836 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HADHQ16836 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HADHQ16836 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HADHQ16836 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HADHQ16836 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HADHQ16836 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HADHQ16836 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HADHQ16836 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HADHQ16836 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HADHQ16836 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HADHQ16836 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HADHQ16836 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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