Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
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