Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms