Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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