Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCN9AQ15858 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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