Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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EFNB3Q15768 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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EFNB3Q15768 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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EFNB3Q15768 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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EFNB3Q15768 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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EFNB3Q15768 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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EFNB3Q15768 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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EFNB3Q15768 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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EFNB3Q15768 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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EFNB3Q15768 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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EFNB3Q15768 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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EFNB3Q15768 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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