Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms