Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms