Protein–RNA interactions for Protein: Q14574

DSC3, Desmocollin-3, humanhuman

Predictions only

Length 896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC3Q14574 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC3Q14574 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC3Q14574 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms