Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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GBX1Q14549 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBX1Q14549 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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GBX1Q14549 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
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GBX1Q14549 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GBX1Q14549 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GBX1Q14549 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GBX1Q14549 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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GBX1Q14549 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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GBX1Q14549 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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GBX1Q14549 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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GBX1Q14549 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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