Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms